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[워크숍] 제 1차 ‘수생태계 조사를 위한 eDNA 활용 교육'

해양저서생태학연구실l 2024-09-27l 조회수 106

제 1차 ‘수생태계 조사를 위한 eDNA 활용 교육’

일시: 2024.09.25-09.27, 장소: 전남대학교 여수캠퍼스

<제 1차 수생태계 조사를 위한 eDNA활용교육'

2024년 9월 25일부터 9월 27일까지 전남대학교 여수캠퍼스에서 ‘수생태계 조사를 위한 eDNA 활용 교육’이 진행되었습니다.

본 교육은 eDNA 연구를 시작하려고 하는 연구자들을 위한 기초 교육으로 시료 채집, DNA 추출, 자료 분석을 배울 수 있습니다. 이번 교육은 서울대학교의 이경민 학생이 참가했습니다.
 


첫째날은 곽인실 교수님의 개회사로 시작했고, 이후 국립낙동강생물자원관의 배미정 박사님께서 eDNA 분석을 위한 환경시료 채집 및 안전 유의사항에 대해 강연해주셨습니다. 강연 후엔 연등천, 연등천 생태 습지, 서시장 인근에서 eDNA 분석을 위한 환경시료를 채집했습니다. 채집 후엔 학교로 돌아와 eDNA 분석 절차에 대한 이론교육을 듣고 실험실로 이동해 직접 eDNA 추출과 정량, 1차 PCR을 해봤습니다.


둘째날은 eDNA 분석 절차 이론교육을 시작으로 전날 1차 PCR의 결과물을 가지고 clean up을 하고 2차 PCR을 실시했습니다. 이후 NGS loading까지 배울 수 있었습니다.

 

실험이 모두 끝난 후에는 인천대학교 정창범 교수님께서 eDNA 연구 및 활용 사례에 대해 소개해주셨습니다. eDNA로 할 수 있는 연구에 대해 설명을 들을 수 있어 뜻깊은 시간이었습니다.

마지막 날은 QIIME2 기반 raw data 정제 등 생물정보 분석에 대해 조선대학교 송호경 교수님께서 직접 실습을 진행해주셨습니다. QIIME 실습 이후엔 R을 이용한 데이터 시각화 방법도 배울 수 있었습니다. 참가자 모두 각자의 노트북으로 직접 생물 정보를 처리해보고 시각화 해볼 수 있는 좋은 시간이었습니다.



좋은 프로그램을 진행해주신 한국환경유전자학회 분들께 감사드리며, 배움의 기회를 주신 김종성 선생님께 이자리를 빌어 감사의 말씀드립니다.